标准 DNA 条形码凭借通用引物适配性强和测序成本低等优势，广泛应用于生物多样性保护与溯源等领域。针对近缘种、杂交频繁及近期辐射演化的复杂类群，标准 DNA 条形码因序列变异度有限，分辨率不足，难以满足精准鉴定的需求。尽管基因组浅层测序获取质体全基因组（超级条形码）的策略提升了部分困难类群的鉴别率，但质体基因组的单亲遗传特性使其在杂交渐渗类群分析中存在局限。
现代主栽香蕉品种高度依赖营养繁殖，存在遗传基础狭窄、遗传多样性低等问题。芭蕉科现存约80个物种，不同类群在染色体基数（如 n =11、10和9）以及花苞颜色等性状上呈现多样性，是研究植物染色体结构演化和花器官性状分化的理想类群。然而，这些不同染色体基数的演化形成机制、染色体结构变异与花苞颜色分化的内在关联，长期以来缺乏基因组与细胞遗传学层面的直接证据。
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